La serie Metroid nunca ha sido una de las franquicias más exitosas de Nintendo, situándose actualmente en el puesto 17 entre sus principales sagas, por detrás de Wario, Duck Hunt y Game & Watch. Esta posición explica por qué los esfuerzos de marketing y redes sociales de Nintendo en torno a Metroid Prime 4 fueron relativamente discretos antes del lanzamiento.
A pesar de una campaña publicitaria más intensa a nivel global, los resultados en Japón muestran que Metroid Prime 4 ha tenido un desempeño muy inferior al esperado. En su segunda semana en Japón, vendió apenas 3,381 unidades físicas, acumulando un total de 32,382 copias físicas en dos semanas, cifras muy por debajo de otros títulos de Switch y de entregas previas de la saga.
Históricamente, Japón nunca ha sido un mercado fuerte para Metroid Prime, ya que los juegos de estilo FPS no son muy populares entre los jugadores japoneses. Para ponerlo en perspectiva, Metroid Dread vendió alrededor de 108,000 unidades físicas en sus primeras dos semanas, tres veces más que Prime 4, mientras que otros títulos como Kirby Air Riders y Donkey Kong Bananza lograron ventas mucho mayores en periodos similares.
Comparando con entregas anteriores, Metroid Prime 4 vendió menos copias en sus primeras dos semanas que Metroid Prime y Metroid Prime 3 en sus respectivas semanas de estreno. Aunque entonces no existían las ventas digitales, la comparación indica que la recepción física en Japón ha sido particularmente baja, un signo preocupante para el éxito comercial del juego.
El desarrollo de Metroid Prime 4: Beyond fue notoriamente problemático: anunciado en 2017, su desarrollo se reinició en 2019 con Retro Studios, y finalmente vio la luz en diciembre de 2025, seis años después del reinicio. Los costos de desarrollo fueron significativos, por lo que las 32,000 copias físicas vendidas en Japón apenas cubrirán una fracción de la inversión realizada, reflejando un inicio comercial débil para el título.
